Analyse du transcriptome de fruits de fraises (Fragaria × ananassa) sous stress osmotique et identification de gènes liés à la voie de l'acide ascorbique.

La fraise (Fragaria ananassa Duch.) Est un fruit important du point de vue économique et très demandé en raison de son bon goût et de ses propriétés médicinales. Cependant, sa culture est affectée par divers stress biotiques et abiotiques. Les plantes présentent plusieurs mécanismes intrinsèques pour gérer les stress. Dans le cas de la fraise, les mécanismes soulignant la réponse à ces stress restent à élucider, ce qui a entravé les efforts pour développer et cultiver des plants de fraise avec un rendement et une qualité élevés. Bien qu'un génome de référence virtuel de F. ananassa ait été publié récemment, l'information sur l'expression des gènes en réponse à divers stress fait toujours défaut. Par conséquent, afin de fournir des informations moléculaires pour des études ultérieures sur les fraisiers, nous présentons le jeu de données de transcriptome de référence de F. ananassa, assemblé et annoté à partir de données RNA-Seq profondes de fruits cultivés sous des contraintes de salinité et de sécheresse. Nous avons également systématiquement organisé une série de transcripts exprimés de manière différentielle au cours de ces stress, en mettant l'accent sur les gènes liés à l'accumulation d'acide ascorbique (AsA). L'acide ascorbique est l'antioxydant le plus puissant présent dans ces fruits et est très pris en compte lors de la biofortification. Une comparaison du profil d'expression de ces gènes par RT-qPCR avec le contenu d'AsA dans les fruits a permis de vérifier une régulation stricte et un équilibre entre l'expression des gènes, issus des voies de biosynthèse, de dégradation et de recyclage, entraînant une réduction du contenu d'AAs dans les fruits. sous ces contraintes. Ces résultats fournissent un répertoire utile de gènes pour l'ingénierie métabolique, améliorant ainsi la tolérance au stress.

Source: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30367706